Thomas og hans gruppe af undslupne sætter alt ind på at finde en kur mod den frygtelige sygdom, som forvandler mennesker til zombie-lignende væsner. Derfor forsøger de at bryde ind i 'Last City'. Men for at komme ind i den, skal de igennem den farligste labyrint, de nogensinde har stået over for. Vil det lykkes dem at komme levende ind i byen - og vil de endelig få svar på de spørgsmål som har fulgt dem, siden de vågnede op inde i den første labyrint?