Cody et Astor partis vivre chez leurs grands-parents, Dexter a désormais plus de liberté pour traquer les tueurs en série. Sa nouvelle cible est le "Tueur du jugement dernier", un expert en théologie qui veut provoquer la fin du monde à travers ses meurtres. En parallèle, Debra, qui est promue lieutenant contre son gré, est chargée de cette affaire délicate.