Brooklyn Nine-Nine handler om den dygtige kriminalbetjent Jake Peralta (Andy Samberg). Han arbejder sammen med en gruppe strømere i Brooklyn. Men en dag får de en ny chef, som har en hel masse, han skal bevise.
Peralta har så meget talent for politiarbejde, at han aldrig har behøvet at arbejde særligt hårdt eller at følge reglerne. Han er altid den, der opnår de bedste resultater og har derfor fået særbehandling gennem hele sin karriere. Men det bliver der lavet om på, når distriktet får en ny chef, politileder Kaptajn Ray Holt (Andre Braugher), som sætter en ære i at følge regler og reguleringer til punkt og prikke.