Mutou Jugi egy 16 éves gimnazista fiú egyedül él nagyapjával. Kevés barátjához hasonlóan ő is rajongója egy népszerű kártyajátéknak, amit Duel Monstersnek („Szörnyek párbaja”) hívnak.
Egy napon Jugit megzsarolják, méghozzá maga a kártyajáték megalkotója, Pegasus J. Crawford. A férfi felfedi Jugi előtt, hogy a nagyapjától 8 éves korábban kapott kirakója valójában egy Ezeréves Ikon, amelyet az ókori egyiptomiak alkottak meg, és természetfeletti hatalommal bír. Pegasus a bal szemén szintén visel egy ilyen ikont, és erejét demonstrálva elragadja Jugi nagyapjának lelkét. Juginak egyetlen esélye van, hogy visszaszerezze: ha benevez Pegasus Duel Monsters-tornájára, és megküzd vele a döntőben.
Jugi elmegy a torna küzdőteréül szolgáló szigetre, ahova vele tartanak barátai: Dzsónócsi Kacuja, Honda Hiroto és Mazaki Anzu. Jugi idővel rájön, hogy egy halott fáraónak a szelleme lakozik a kirakójában, aki mentális erővel ruházza fel végcélja eléréséhez.