Yusei et ses amis arrivent dans la Citadelle de la Peur, mais sont très vite séparés en trois groupes, selon les plans de Z-one. Chaque groupe s'aventure dans les trois différents Engrenages Planétaires au centre de la structure. Cependant, Sherry barre la route de Crow et Akiza. Elle ne les laissera passer que s'ils gagnent contre elle. Elle utilise alors la carte "École de Zone" pour se "diviser" en deux afin de les affronter séparément.